真菌毛囊炎与湿疹不同，前者是真菌感染引起的局部炎症，而后者是一种慢性炎症性皮肤疾病。
真菌毛囊炎主要是由真菌如糠秕孢子菌等在毛囊部位大量繁殖所引起的一种炎症反应；而湿疹则是由于机体内部和外部因素相互作用导致的皮肤屏障功能障碍和免疫应答异常所致。两者的病因、临床表现及治疗方法均不相同，因此需要区别开来。
患者还应注意是否伴随瘙痒症状，因为瘙痒是湿疹的主要特征之一，而毛囊炎通常不会引起瘙痒感。
针对真菌毛囊炎和湿疹这两种不同的皮肤状况，在诊断时需进行适当的实验室检查以确定具体原因，并制定相应的治疗方案。患者平时要保持良好的个人卫生习惯，避免共用毛巾等生活用品，以防交叉感染。
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